自动化专业创办于2001年，现为浙江省高校新兴特色专业，拥有省级示范中心建设基地（电工电子实验中心）和绍兴市级示范中心建设基地（机电控制及自动化技术专业实验室），实验室面积合计4228余平方米，实验设备合计900余万元。本专业为应用型的工科专业，设有装备电气控制和智能仪器仪表两个方向，培养具有自动化工程技术基础和专业知识、具有较强实践能力、能从事智能仪器仪表设计、装备电气控制等方面工作的高级应用型人才。自动化专业目前有8个教学班，全日制在校学生240余人，近五年平均就业率为97.63%，平均每年有2-3名学生考上研究生。
本专业引进了先进的国际化教育理念，在学生培养方面已与美国南方理工州立大学（Southern Polytechnic State University）正式签订2+2合作协议。按照协议，本专业学生可以申请去美国南方理工州立大学学习，两校学分互认，学生赴美学习可以获得美国南方理工州立大学的文凭。目前学校还与美国苏必利尔湖大学（Lake Superior State University）有合作协议，学生可以短期去苏必利尔湖大学进行学习。
本专业现有教师23人，其中主讲教师16人。主讲教师中教授4人，副教授6名，高级职称比例达到62.5%； 其中博士6人、硕士6人，具有硕士及以上学位的教师所占比例为75%；教师平均年龄40岁左右。有省青年科学家培养对象4名，省高校中青年学科带头人1人，省“151”人才1人，校学科带头人2人，校拨尖人才2人，校中青年学科带头人2人。现有省级电工电子创新教学团队1个，省级精品课程和市级精品课程各1门，省重点建设教材1部，获国家教学成果奖二等奖1项、省教学成果奖一等奖1项、省级教改项目3项。
自动化专业教师紧密结合绍兴地区纺织印染装备、微特电机等产业发达的地方优势，明确了纺织印染装备自动化、智能仪器仪表、智能控制与机器人等研究方向，先后承担省重大专项2项、省自然基金项目4项， 省公益性项目2项，厅市级项目10余项，发表论文100余篇，其中SCI/EI等收录60余篇，相关本学科领域权威国际学术期刊论文20篇，拥有自主产权的专利20余项。
